Служба (лабораторија) за медицинску микробиологију налази се у истим просторијама од свог оснивања.
У свом саставу има следеће одсеке за дијагностику:
1. Пријемно одељење
2. Одсек за туберкулозу
3. Одсек за општу бактериологију
4. Одсек за паразитологију и ентеробактерије
5. Одсек за вирусологију и имунологију
6. Одсек за стерилизацију
7. Одсек за прављење хранљивих подлога
Поштујући принципе добре лабораторијске праксе и постављајући квалитет и ефикасност као основу нашег деловања у пружању услуга колегама и пацијентима, микробиолошка лабораторија је оспособљена да уради 90% дијагностичких процедура из ове области.
Време потребно за појединачну дијагностичку процедуру у нашој лабораторији се креће од неколико сати (за имунолошке тестове) до 72 сата (за бактериолошку дијагностику са антибиограмом) и од 21-60 дана за дијагностику туберкулозе. Годишње ова лабораторија обради 60.000 узорака и уради око 150.000 анализа.